La L-cisteina è utilizzata principalmente in medicina, cosmetici, ricerca biochimica; utilizzata nei materiali per il pane per promuovere la formazione di glutine e promuovere la fermentazione, la muffa e prevenire l'invecchiamento. Utilizzato nei succhi naturali per prevenire l'ossidazione della vitamina C e impedire che il succo diventi marrone. Il prodotto ha un effetto disintossicante, può essere utilizzato per avvelenamento da acrilonitrile, acidosi aromatica.
L'acetilcisteina, nota anche come N-acetilcisteina o N-acetil-L-cisteina (NAC), è un farmaco usato per trattare il sovradosaggio e per sciogliere il muco denso come nella fibrosi cistica o nella malattia polmonare ostruttiva cronica.